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陸地棉漆酶基因家族鑒定及在黃萎病菌脅迫下的表達(dá)分析

趙晶; 李旭彤; 梁學(xué)忠; 王志城; 崔靜; 陳斌; 吳立強(qiáng); 王省芬; 張桂寅; 馬峙英; 張艷 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)/華北作物種質(zhì)資源研究與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/河北省棉花產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心; 河北保定071001
  • 陸地棉
  • 漆酶
  • 基因家族
  • 黃萎病
  • 基因表達(dá)

摘要:黃萎病是降低棉花產(chǎn)量和品質(zhì)較為嚴(yán)重的維管束病害。棉花在抵抗病原菌的過程中,抗病基因起著尤為重要的作用。漆酶是一種多功能氧化酶,在植物木質(zhì)素合成和提高植株抗逆性等方面發(fā)揮著重要作用。高質(zhì)量版本的基因組是提升基因家族分析準(zhǔn)確性的必要條件。本研究以目前最新的陸地棉TM-1高質(zhì)量版本基因組為參考,通過生物信息學(xué)分析鑒定了陸地棉基因組中的Laccase(GhirLAC)基因家族,并對(duì)其進(jìn)行了理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、染色體定位以及在黃萎病脅迫下的表達(dá)模式分析。結(jié)果表明,陸地棉TM-1基因組中共包含83個(gè)GhirLAC家族成員,分布在24條染色體上,所有GhirLAC蛋白均定位在胞外,且具有相同/相似的保守基序。系統(tǒng)發(fā)育樹分析顯示,GhirLAC基因家族成員可分為7個(gè)亞組。結(jié)合黃萎病脅迫下棉花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),將GhirLAC基因家族各成員的表達(dá)分為3種模式,其中第1類和第2類GhirLAC基因在黃萎病菌脅迫下分別呈現(xiàn)有規(guī)律的表達(dá)量升高和降低,推測(cè)這些基因在棉花抗黃萎病反應(yīng)中發(fā)揮重要功能。熒光定量PCR結(jié)果表明,GhirLAC02(GhLAC4)、GhirLAC38(GhLAC11)和GhirLAC20(GhLAC12)3個(gè)候選基因均受黃萎病菌誘導(dǎo)表達(dá),其表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)相吻合。本研究為以后深入解析棉花GhirLAC基因的抗病功能及分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

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