基于聚類分析的肺癌與基因相關關系研究
任雪菁; 安新穎; 范少萍 北京協和醫學院/中國醫學科學院醫學信息研究所; 北京100020
- 肺癌
- 基因
- 文本挖掘
- 數據挖掘
- 聚類分析
摘要：目的:研究與不同類型肺癌存在關聯的基因及其與肺癌的關聯,為肺癌相關基因領域的研究學者提供參考。方法:通過對肺癌、基因進行命名實體識別、實體數據的標準化處理、肺癌-基因矩陣構建、肺癌-基因矩陣的聚類分析、文獻回溯等,基于聚類的方法發現不同類型肺癌存在關聯的基因及其在肺癌不同階段的具體關聯。結果:利用聚類分析的方法將肺癌大致分為A549 lung cancer,Advanced non-small-cell lung cancer,small cell lung carcinoma四大類。高頻基因主要是EGFR(在晚期非小細胞肺癌患者體內突變率較高)、P53(主要在NSCLC晩期患者中高水平突變表達)、KRAS(主要與NSCLC有關)。結論:基因、蛋白質、化學物質等實體對肺癌的產生與治療至關重要。深入探究肺癌與基因的關系對肺癌的預防、診斷、治療均有重要意義。
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