新疆石河子部分地區豬流行性腹瀉病毒遺傳變異分析
黃新; 吳桐忠; 韓猛立; 張星星; 何延華; 鐘發剛 新疆農墾科學院/省部共建新疆綿羊遺傳改良與健康養殖國家重點實驗室; 新疆石河子832000
- 豬流行性腹瀉病毒
- 遺傳進化
- s基因
- orf3基因
- 新疆石河子
摘要：為分析豬流行性腹瀉病毒(PEDV)遺傳變異情況,從石河子的3個地區已確診PED豬場采集病料,分別獲得了3株PEDV S基因序列和ORF3基因序列,將其進行序列比對及遺傳進化分析。根據3株S基因序列分析表明,XJ-SHZ148、XJSHZ146株與韓國QIAP1401株(KX793713)序列相似性最高,達到97.4%和98.7%;XJ-SW株與廣東GD-03 2012株(KP870115)序列相似性最高,達到98.5%。3個分離株與PEDV疫苗株AF353511(CV777)性序列相似性分別為94.5%、94.2%和94.1%。系統進化分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146與韓國的KPV1406(KM108353))、QIAP1401(KX793713))同為一群。XJ-SW株與廣東GD/03/2012((KP870115))、GD/2011株(KP870115)同為一群;3株PEDV ORF3基因序列與疫苗株(CV777)序列比對多個位點存在突變,序列相似性較低。
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