摘要:以微泡菌(Microbulbifersp.)ALW1的基因組為模板,利用幾丁質(zhì)酶基因的特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后將產(chǎn)物插入到pMD18-T載體后進(jìn)行DNA序列測(cè)定,并對(duì)目的基因編碼的蛋白質(zhì)序列進(jìn)行信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,克隆的目的基因大小為1644bp,預(yù)測(cè)編碼含有547個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)序列與其他菌株來(lái)源的幾丁質(zhì)酶序列具有70%左右的相似性,表明預(yù)測(cè)目的基因編碼幾丁質(zhì)酶。該蛋白質(zhì)具有2個(gè)幾丁質(zhì)結(jié)合結(jié)構(gòu)域和1個(gè)GH18家族酶的催化結(jié)構(gòu)域,屬于糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)家族18,命名為幾丁質(zhì)酶Chi18A。模擬的三維結(jié)構(gòu)顯示,Chi18A含有(βα)8桶狀結(jié)構(gòu)。
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