基于重測序的籽粒型和鮮食型大豆的全基因組變異分析
郭丹丹; 袁鳳杰; 郁曉敏 浙江省農業科學院作物與核技術利用研究所; 杭州310021
- 全基因組重測序
- 籽粒大豆
- 鮮食大豆
- 單核苷酸多態性
- 結構變異
摘要：為揭示籽粒型和鮮食型大豆基因組間的差異,本研究對2個籽粒大豆品種‘浙春3號’、‘浙春4號’和2個鮮食大豆品種‘浙鮮豆8號’、‘浙鮮9號’進行全基因組重測序,平均測序深度為6X,覆蓋度大于94%。通過與參考基因組比對發現,籽粒大豆平均雜合率12.24%,鮮食大豆平均雜合率10.97%,籽粒型大豆雜合度高于鮮食型。2個籽粒型大豆插入和缺失變異占總變異21.89%,染色體間易位變異占總變異41.04%;而2個鮮食型大豆缺失變異占總變異22.38%,染色體間易位變異占總變異46.15%,籽粒型大豆缺失變異率和染色體間易位變異率均低于鮮食型大豆。研究結果在一定程度上反映了籽粒型大豆和鮮食型大豆在基因組水平的差異,為分子標記輔助選擇育種提供了科學依據。
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