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基于CO I和Cyt b DNA條形碼在鲌屬魚類物種鑒定中的應(yīng)用

王利華; 羅相忠; 王丹; 李偉; 李忠; 鄒桂偉; 梁宏偉 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所; 武漢430223; 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所; 廣州510380; 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部水生動(dòng)物基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 武漢430223
  • 鲌屬
  • coi
  • cytb
  • 物種鑒定
  • 系統(tǒng)進(jìn)化

摘要:為探究線粒體CO I和Cyt b基因作為DNA條形碼在鲌屬魚類鑒定中的可行性,分別擴(kuò)增達(dá)氏鲌(Culter dabryi)、海南鲌(C.recurviceps)、尖頭鲌(C.oxycephalus)、蒙古鲌(C.mongolicus)、擬尖頭鲌(C.oxycephaloides)和翹嘴鲌(C.alburnus)六種鲌屬魚類線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基I(Cytochrome C oxidase subunit I,CO I)和細(xì)胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)的基因片段,并對(duì)六種鲌屬魚類同源序列的堿基組成、種內(nèi)與種間遺傳距離以及系統(tǒng)進(jìn)化分別進(jìn)行分析。結(jié)果表明:長(zhǎng)度為645 bp的CO I基因片段中,A、T、G、C4種堿基平均含量分別為25.65%、28.18%、18.33%和27.84%;長(zhǎng)度為970 bp的Cyt b序列片段中,A、T、G、C堿基平均含量分別為27.97%、27.93%、14.53%和29.57%。基于CO I基因序列的種間平均遺傳距離為3.54%,種內(nèi)平均遺傳距離為0.17%,種間遺傳距離為種內(nèi)遺傳距離的20.82倍;基于Cyt b基因序列的種間平均遺傳距離為5.92%,種內(nèi)平均遺傳距離為0.18%,種間遺傳距離為種內(nèi)遺傳距離的32.89倍。基于CO I基因的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系顯示除尖頭鲌與擬尖頭鲌外,其余4種鲌均形成獨(dú)立分支,而基于Cyt b基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系顯示六種鲌屬均能獨(dú)立形成分支,鲌屬六種魚能夠進(jìn)行有效區(qū)分,將CO I和Cyt b作為DNA條形碼進(jìn)行鲌屬魚類的物種鑒定是可行的,聯(lián)合使用可以獲得更好的鑒定效果。

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淡水漁業(yè)

  • 預(yù)計(jì)1-3個(gè)月 預(yù)計(jì)審稿周期
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  • 農(nóng)業(yè) 快捷分類
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所;主辦單位:中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所

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